| Temporada 3 01. Camino de Bendición
La comunidad de navajos rescata a un moribundo Mulder y le somete a un ritual de sanación que sitúa al agente entre dos mundos. Mientras, Scully se enfrenta a las consecuencias de las acciones de ambos y es suspendida del servicio. La cinta DAT ha desaparecido... 02. Paperclip
Con la fotografía de su padre y la ayuda de "El Tirador Solitario", los agentes logran localizar a un antiguo criminal de guerra nazi, implicado en una operación gubernamental secreta. Este les dirige a una mina de Virginia, donde se oculta buena parte de los secretos del Plan Maestro... 03. D.P.O
Varios jóvenes han muerto a causa de la caída de rayos en Connerville. Los agentes investigan tan improbables sucesos e interrogan al único superviviente de los incidentes, Darrin Oswald. Este, un adolescente problemático, parece implicado en los sucesos. 04. El descanso final de Clyde Bruckman
Un asesino en serie tiene una fijación por acabar con presuntos videntes. Ya ha cometido varios asesinatos cuando se ve implicado Clyde Bruckman, un hombre con la capacidad de visualizar la muerte de otros. Reluctántemente, Bruckman accede a ayudar a los agentes. 05. La Lista
Un ejecutado parece haber vuelto de la tumba para realizar su venganza sobre un grupo de cinco personas que le torturaron en vida. El brutal alcalde de la prisión teme que es una conspiración entre los ocupantes del Corredor de la Muerte y algún carcelero para acabar con su vida. 06. Demasiado Tímido
Una serie de cadáveres que han sido despojados de todo su tejido graso anuncia la existencia de un extraño asesino en serie. Los agentes descubren que contacta con sus víctimas a través de InterNet e intentan tenderle una trampa. 07. El Paseo
En un Hospital de Veteranos de la Guerra del Golfo, un oficial intenta quitarse la vida sin lograrlo. Acusa de sus fracasos a una presencia fantasmal que lo tortura y que ha acabado con su familia. Cuando llegan los agentes, descubren que el Director del Hospital está también amenazado por la presencia. 08. Mazmorra
El secuestro de una niña produce un extraño efecto sobre la víctima de otro secuestro: sufre heridas y sangra con la sangre de aquella. Mulder intenta que la joven colabore con ellos en la resolución, pero esta no desea verse involucrada. Las autoridades, en cambio, sospechan que está implicada en el nuevo delito. 09. Nisei
Mulder investiga una cinta que presuntamente contiene la autopsia de un ser extraterrestre. Al llegar al lugar de la productora, detienen a un japonés, que resulta ser un diplomático al que tienen que liberar. El hombre lleva una lista de miembros de sociedades de investigación OVNI y una serie de fotografías de satélite. Scully investiga la lista y encuentra un grupo de mujeres que afirman haber sido abducidas. Entretanto, Mulder identifica con la ayuda de "El Tirador Solitario" un misterioso vagón en Virginia. Cuando acude a investigar, contempla como algo no humano es introducido en el vagón... 10. 731
Mulder se enfrenta, a bordo del tren, a un asesino gubernamental intentando eliminar las pruebas: el ser encerrado en el vagón, que es claramente no humano. Una bomba amenaza con acabar con su vida. Entretanto, Scully acude a una leprosería donde descubre pruebas de un genocidio. 11. Revelaciones
Un asesino en serie está acabando con todos los predicadores que presentan presuntos estigmas. Mulder y Scully acuden para proteger a un joven que muestra los mismos estigmas y se enfrentan a una serie de sucesos que ponen a prueba las creencias religiosas de la agente. 12. La Guerra de los Coprófagos
Aburrido en su día libre, Mulder se dirige a Miller's Grove, lugar de avistamientos OVNI. Sin pretenderlo, se ve envuelto en una serie de misteriosas muertes, que le hacen sospechar que hay una invasión alienígena en marcha y que la vanguardia la forman... cucarachas. 13. SyZygy
Una alineación de estrellas convierte a un pueblo en un "Punto G cósmico", produciendo extraños comportamientos en sus habitantes... incluyendo a Mulder y Scully que han venido a investigar. Dos chicas, nacidas en mismo día y a la misma hora se ven especialmente afectadas. 14. Grotesco
Mulder se enfrenta a uno de sus antiguos profesores cuando este solicita su ayuda en la resolución de un caso. Aunque el presunto asesino ha sido detenido, todo parece indicar que hay otro actuando de forma similar: ¿un imitador?, ¿un cómplice?. Mulder sostiene otra teoría: posesión. 15. Piper Maru
Un barco de salvamento francés encuentra en un submarino un misterioso ser que se apodera de los tripulantes. En Washington, un grupo exige al Director Adjunto Skinner que cierre la investigación del asesinato de Melissa Scully. Mulder sigue hasta Extremo Oriente a un misterioso hombre de negocios y se encuentra con Alex Krycek, que está intentando negociar con la cinta DAT que contiene la información robada al gobierno. 16. Apócrifo
Scully investiga el intento de asesinato de Skinner. El tirador parece ser el mismo que asesinó a su hermana, Luis Cardinal. Mulder y Krycek llegan a los Estados Unidos, solo para ser atacados por hombres del Fumador de Cigarrillos, que raptan a Krycek y dejan al agente inconsciente. 17. Pusher
Un asesino serial confiesa ser responsable de 14 asesinatos perfectos. Haciendolos pasar por suicidios nadie habia sospechado hasta su voluntaria confesion. Su metodo era una especie de control mental con el que dominaba las acciones de las victimas induciendolas a la muerte. La fuga de Pusher hace que Mulder y Scully intervengan en el caso. 18. Teso Dos Bichos
La misteriosa desaparicion de miembros de una expedicion arqueologica en la que se habia profanado una tumba de una sacerdotiza precolombina hace que la seccion X del FBI se interese en el caso. La maldicion que habian advertido los aborigenes del lugar donde encontraron la tumba estaba en marcha y la unica forma de detenerla seria regresar la momia a su lugar. 19. Dinero del Infierno
Misteriosas muertes en Chinatown hacen que Mulder y Scully penetren en la cerrada comunidad china. Ayudados por un detective de origen oriental descubriran que lo que parecia una intervencion sobrenatural de fantasmas ancestrales era una compleja operacion de trafico y venta de organos humanos para transplantes. 20. Del Espacio Exterior, de Jose Chung
Un escritor de Ciencia Ficcion se intereza por un caso de abduccion de dos jovenes, y es Scully la encargada de darle la version de los hechos. Las seciones de hipnosis revelaban relatos divergentes, desde una lucha de extraterrestres con seres del centro de la tierra, hasta el secuestro de los jovenes por parte de las fuerzas armadas, esto, junto a la existencia de un video que corresponderia a la autopsia de un extraterrestre hacen que el caso se complique enormemente, aun para los experimentados agentes. 21. Avatar
Una historia donde el director Skinner aparece como principal sospechoso de la muerte de una joven. La pesadilla recurrente en la que Skinner era acechado por una mujer mayor vestida de rojo parece ser la clave. Para Mulder la vieja era un espiritu que se interpondria y destruiria a toda mujer que pretendiera al director. Pero investigando mas profundamente la conspiracion para sacar a Skinner de su cargo se hace evidente. 22. Atolladero
.Varias desapariciones en torno a un remoto lago llamaron la atencion de Mulder ya que conocia la leyenda que hablaba sobre la existencia de un monstruo en el fondo del lago. Un biologo que investigaba la depredacion de ranas en el lugar minimiza la version del monstruo pero los cuerpos mutilados de los desaparecidos comienzan a aparecer y las explicaciones no. 23. Cableado
Un hombre de pacifica existencia asesina a 5 personas incluyendo a su esposa convencido de que mato las 5 veces al mismo individuo. A esto se sumaba mas tarde la exaltacion violenta que le provocaba la aparicion de noticias sobre Bosnia en la TV. Alertados, los agentes X descubririan mas tarde un dispositivo que modificaba la frecuencia de las emiciones televisivas y estas actuaban subliminalmente volviendo paranoicos a los receptores. 24. Talitha Cumi
La investigacion de Jeremiah, un sereno individuo que hace sanar heridas mortales simplemente tocandolas con su mano es bruscamente interrumpida cuando Mulder recibe la noticia que su madre ha sido hospitalizada. Seguidamente X le entrega a Mulder fotos de su madre discutiendo con el fumador y le informa que se conocian hacia tiempo. La aparicion del alienigena asesino y de varias personas identicas y del mismo nombre que el misterioso sanador hace que todos los acontecimientos se relacionen peligrosamente.
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