Temporada 2

01. Puntos de Partida
El Comandante Sinclair es reclamada en la Tierra. Mientras un nuevo oficial se hace cargo de la Babylon 5, el Capitán John Sheridan, que no será del agrado de los Mimbari. Delenn continua con su transformación, dando lugar a un nuevo ser y descubriéndose porque los Mimbari se retiraron en la guerra.

02. Revelaciones
Londo y Morden continuan con sus charlas para que los Centauri recuperen su antiguo poder y acabar con los Narn. Garibaldi que había sido herido de gravedad es tratado por el doctor Franklin con la máquina de curación y Talia le ayudará a encontrar al que le disparó. La hermana pequeña de Sheridan llega a la estación y reabre viejas heridas por la muerte de su esposa. Delenn se presenta ante todos con un nuevo aspecto.

03. La Geometria de las Sombras
Ivanova es promocionada de rango a Capitán y se le asigna una misión diplomática para mediar entre dos facciones. A su vez Londo recibe la visita de un noble de Centauri, el cual junto a un grupo quieren hacerse con el poder cuando el Emperador muera. Un grupo llamado los Tecnomagos llegan a Babylon 5 con la intención de marcharse lejos de todos y vaticinando una proxima oscuridad. Garibaldi se cuestionará si es un jefe de seguridad competente.

04. Una Estrella Lejana
Un amigo explorador del Capitán Sheridan le advierte de algunas cosas extrañas. Cuando parte de la estación Babylon 5, se pierde en el hiperespacio, necesitando ayuda de Sheridan. La lealtad de Delenn hacia los Mimbari es cuestionada. Ella y Sheridan empiezan a desarrollar un mutuo afecto.

05. La Larga Oscuridad
Una vieja nave criogénica terrestre llega a Babylon 5 con dos cuerpos. Uno de ellos está muerto, mientras que el otro al despertarlo dice ser su mujer. Un excombatiente de la guerra asegura que el mal ha llegado con esa nave. La nave será registrada, con el fin de encontrar a esa criatura.

06. Una Araña en la Telaraña
Talia se ve envuelta en una intriga, cuando presencia un asesinato y están a punto de matarla a ella también. Garibaldi investigará el caso encontrando que el asesino es un terrorista a favor de la libertad de Marte. Talia percibirá algo detrás de este asesinato.

07. Una Carrera a través de Lugares Oscuros
Bester pide ayuda a Talia, ya que el Cuerpo Psíquico usa a los telépatas peligrosamente. El doctor Franklin hablará con Sheridan, explicandole todo lo que sabe sobre estas actividades de los telepatas. Delenn aprenderá junto a Sheridan su propia humanidad.

08. Compañeros del Alma
Londo recibe el permiso del Emperador para divorciarse de 2 de sus 3 esposas. Con las tres reunidas abordo de la estación, decidirá quedarse con la que le cuide mejor. El ex marido de Talia aparece en la Babylon 5, con la idea de reavivar su antigua relación, pero ocultandose detrás un oscuro motivo, a lo que Garibaldi le advertirá.

09. La llegada de las Sombras
El Emperador de Centauri visita Babylon 5. Un sospechoso hombre sigue a Garibaldi. Lord Refa y Londo inician una ofensiva contra una colonia Narn destruyéndola. G'Kar intenta matar al Emperador de Centauri, pero es demasiado tarde porque su grave enfermedad acaba por matarle. En Centauri el Primer Ministro es asesinado y Lord Refa se hace con el poder. Garibaldi consigue que el extraño le de un mensaje de un viejo amigo. G'Kar declara oficialmente la guerra a los Centauri.

10. Gropos
Cuando el padre del doctor Franklin llega a Babylon 5 con 25.000 soldados a su cargo para una misión secreta, el personal de la estación se incomoda por la falta de habitaciones. Garibaldi iniciará una relación con una soldado. El doctor Franklin intentará relacionarse otra vez con su padre.

11. Solo en la Noche
Cuando una serie de desapariciones ocurren, Sheridan investiga pero es capturado también. Delenn a su vez visita al Consejo Gris y debido a su nueva condición deciden que deje su cargo. Se descubre una conspiración en las altas esferas terrestres.

12. Actos de Sacrificio
Las hostilidades entre los Narn y los Centauri continuan. G'Kar pide a Sheridan que la Tierra les ayude, pero no puede hacerlo de forma oficial. Ivanova tratará con miembros de una nueva raza, los Lumari, para entrar a formar parte de la Alianza terrestre.

13. Cazador Presa
El médico del Presidente de la Tierra, llega a la Babylon 5 con información sobre el estado de Santiago antes de su muerte. Un agente especial es enviado para detenerle. El embajador Kosh participará ayudando a ocultar al fugitivo.

14. Y ahora una Noticia
Una periodista de una cadena de noticias llega a la Babylon 5 para efectuar un reportaje, cuando una batalla tiene lugar entre los Narn y los Centauri. Los miembros de la tripulación y los embajadores darán su punto de vista en las entrevista que hace la periodista.

15. Mentir por Honor
Sheridan es acusado de asesinar a un importante Mimbari. Delenn tratará de ayudarle, ya que no le cree capaz de tal cosa. El gobierno de Centauri quiere reemplazar a Vir como asistente de Londo.

16. Cuchillos
Londo recibe a un viejo amigo, el cual está en contra del nuevo Emperador, teniendo que tomar una seria decisión. Mientras tanto Sheridan empieza a tener extrañas visiones y a perder el control de sus actos.

17. A la sombra de Z'Ha¨Dum
Sheridan encarcela a Morden, el cual ha llegado como invitado de los Centauri. Kosh y Delenn le piden que le libere, ya que detrás de él se esconden las Sombras y todavía no están preparados para luchar contra ellas. Mientras tanto van llegando más refugiados Narn.

18. Confesiones y Lamentaciones
Una grave plaga azota a los Markab de la Babylon, mientras el doctor Franklin lucha contra reloj para encontrar una cura y detener la epidemia.

19. La larga Batalla Crepuscular
Se produce el desenlace de la batalla Narn/Centauri, donde los Centauri gracias a la ayuda de las Sombras consiguen destruir la flota Narn, para luego destruir el planeta principal de los Narn.

20. Lealtades Divididas
Cuando Lyta Alexander la primer telépata de la estación llega abordo, asegura que entre los miembros de la tripulación hay un espía del Cuerpo Psíquico, el cual no sabe que lo es, ya que de forma inconsciente su personalidad desaparecerá para ser sustituida por otra. Ivanova deberá despedirse de alguien.

21. Llega el Inquisidor
Kosh manda llamar a un inquisidor para que haga una prueba de la lealtad de Delenn hacia los Mimbari. Al mismo tiempo G'Kar reunirá a los supervivientes Narn en las Babylon 5, para iniciar una resistencia contra los Centauri.

22. La Caida de la Noche
La Tierra envía una representación para recabar información entre los embajadores, con la intención de pactar con los Centauri. Un crucero Narn llega a la estación pidiendo asilo y Sheridan lo concede, pero ante la tensión del momento por la llegada de una nave Centauri, les ayudará a escapar.