El almacén que guarda objetos mágicos y sobrenaturales recogidos a lo largo de los años en todos los rincones del mundo es el protagonista de esta serie llena de aventuras y misterios.
Después de salvar la vida al presidente de los Estados Unidos, los agentes Pete Lattimer (Eddie McClintock) y Myka Bering (Joanne Kelly) son destinados de forma inmediata al Warehouse 13, un almacén gigantesco escondido en Dakota del Sur. Allí, los servicios secretos norteamericanos guardan cientos de extraños artefactos, misteriosas reliquias, objetos fantásticos y sobrenaturales recolectados a lo largo de los años por el Gobierno y que suponen una amenaza para la humanidad. Los dos agentes no pueden ser más distintos. Lattimer es un atractivo, vanidoso y atlético policía cuyo carácter impulsivo le hace a veces reaccionar antes de tiempo. La agente Myka Bering es una mujer completamente entregada a su tarea, y defensora del trabajo duro y organizado. Sus dos formas de entender el mundo les harán chocar en más de una ocasión.
En su nuevo destino, descubrirán lo que se esconde en el almacén de la mano de Artie Nielsen, el encargado del Warehouse 13, quien les guiará en la búsqueda de nuevos objetos que puedan suponer una amenaza para la humanidad. Claudia Donovan es la persona encargada del complejo sistema de seguridad del almacén, aunque su curiosidad la llevarán a pedirle a Nielsen que le deje participar en sus misiones. Siempre enigmática, la señora Frederic es la supervisora de la misión, y quien dirigirá al equipo en sus investigaciones en busca de extraños, peligrosos y amenazantes objetos que deben ser encontrados y guardados bajo control, cueste lo que cueste.