Durante un reconocimiento de rutina de un planeta que se creía destruido hace mucho tiempo atrás por los Wraith, el equipo Atlantis descubre una estructura Ancient parada intacta en medio de las ruinas. Luego de investigar, descubren que el monolito servía de centro de investigación militar en el que los Ancients estaban desarrollando un método avanzado de provisión de energía. Pero cuando los Wraith atacaron antes de que el proyecto estuviera terminado, la tecnología aún incompleta sufrió un desperfecto y destruyo la civilización entera. Según McKay, si hubieran completado el desarrollo, esta nueva y poderosa tecnología hubiera sido una potente fuente de energía para Atlantis. La esperanza se volvió temor, luego de que el intento de McKay por volver a conectar la fuente de energía causó la muerte de uno de los científicos de Atlantis. A pesar de la desconfianza del resto del equipo, un McKay determinado insiste en seguir avanzando con el proyecto. ¿Podrá McKay descifrar la complicada tecnología de los Ancients sin poner en peligro la vida de Sheppard y la de él mismo?